O jogo se passa no ano de 2636, dois anos depois dos acontecimentos de Super Contra. Os protagonistas Bill Rizer e Lance Bean são chamados mais uma vez, contra uma invasão alienígena.
O jogo está dividido em seis niveis, com um chefe no final de cada. Contra Advance: The Alien Wars mantém a tradição da série, alternando entre fases onde a visão é lateral (Side-scrolling) e outras onde a visão que se tem da tela é como se o jogador a estivesse sobrevoando. Há três níveis de dificuldade no jogo — fácil, normal, e difícil. Na versão japonesa do jogo, cada nível de dificuldade vencido mostra um final diferente, na versão americana o final só é mostrado após se vencer o jogo na dificuldade difícil.
Essa versão de GBA tem coisas adicionais.
Nome: Contra Advance: The Alien Wars
Sistema: Game Boy Advance (GBA)
Produtora: Konami
Ano: 2002
Tradução: Dandy-BR
Gêneros: Tiro, Plataforma
Jogadores: 2
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